A Pró-Reitoria de Ensino de Graduação (PROGRAD) é órgão da Administração Superior da Universidade responsável pelo gerenciamento, assessoramento, execução, acompanhamento, controle e avaliação das ações relacionadas com o ensino de graduação e dos cursos sequenciais de oferta regular e especial e nas modalidades presencial e a distância.

Compete à Gerência de Currículos Acadêmicos acompanhar e controlar a execução da programação curricular das atividades relativas ao ensino.

Compete à Gerência de Seleção e Acompanhamento Discente planejar, acompanhar e avaliar os processos seletivos de acesso aos diversos cursos de graduação, tecnólogo, sequencial e outros, com oferta contínua anual, programas especiais, na modalidade presencial.

Compete à Gerência de Implantação e Reconhecimento de Cursos assessorar, sistematizar, analisar e acompanhar os projetos pedagógicos e de cursos com vistas a autorização e implantação, bem assim os de reconhecimento e renovação de reconhecimento de cursos, por meio de suas coordenações e respectivas atribuições.

O Pibid é uma iniciativa para o aperfeiçoamento e a valorização da formação de professores para a educação básica. O programa concede bolsas a alunos de licenciatura participantes de projetos de iniciação à docência desenvolvidos por Instituições de Educação Superior (IES) em parceria com escolas de educação básica da rede pública de ensino.

 Implantada em 2009 pela UNEB, a licenciatura oferta de vagas semestral para índios de comunidades da Bahia, sobretudo para aqueles que atuam como educadores ou gestores de escolas indígenas.